Sejarah Pemerintahan mengkaji konsep, teori, dan praktik pemerintahan khususnya pemerintahan di Indonesia dalam dimensi prosesual maupun struktural. Kajian prosesual mencakup kronologis praktik pemerintahan di Indonesia sejak awal kemerdekaan sampai dengan periode reformasi. Kajian struktural mencakup berbagai macam background sosial, politik, ekonomi, dan budaya, serta kaitannya dengan perkembangan hubungan luar negeri Indonesia yang ikut menentukan berbagai macam perubahan praktik sistem pemerintahan di Indonesia.